В Институте разработана, введена и сертифицирована Система менеджмента качества с июня 2001 года. В настоящее время действует сертификат № RU.MCC.140.179.01707 удостоверяющий, что система менеджмента качества при выполнении инженерных изысканий и разработке проектно-сметной документации на строительство инженерных сооружений и коммуникаций соответствует требованиям ГОСТ ISO 9001-2011 «Система менеджмента качества. Требования».